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Offres d'emploi


  1. L’équipe Cancer et Environnement du Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations (CESP – INSERM U1018) recrute un data-manager/bio-informaticien

    Offre d'emploi. CDD. Val de Marne. Publiée le 14/09/2018.

    Employeur

    Le centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP) regroupe plus de 400 chercheurs, ingénieurs, techniciens et doctorants travaillant dans la plupart des domaines de la santé, comme le cancer, les maladies chroniques et la santé mentale, répartis dans 15 équipes de recherches.

    L’équipe Cancer et Environnement est localisée dans l’hôpital Paul Brousse à Villejuif et est composée d’une vingtaine de personnes. Ses principales thématiques de recherche portent sur l’étude des facteurs de risque des cancers, la caractérisation des expositions aux cancérogènes dans la population et l’étude des déterminants pronostiques des cancers.

    Dans le cadre de projets collaboratifs nationaux et internationaux menés dans l’équipe, des données épidémiologiques détaillées ainsi que des données omiques (données de génotypage, méthylation, séquençage) ont été recueillies ou sont en cours de recueil dans des études portant sur différents sites de cancers (sein, thyroïde, prostate, poumon). L’équipe souhaite recruter un data manager avec de solides compétences en bio-informatique afin de renforcer son expertise dans la gestion et l’utilisation de ces données.

    Coordonnées

    CESP - Equipe Cancer et Environnement

    Hôpital Paul Brousse, Bâtiment 15/16

    16 avenue Paul Vaillant Couturier

    94807 Villejuif cedex

    Description du poste

    Le candidat aura pour rôle de :

    • Développer, maintenir et gérer les différentes bases de données omiques de l’équipe en lien avec les différents collaborateurs
    • Organiser le traitement et le contrôle qualité de ces données
    • Effectuer leur annotation biologique fonctionnelle
    • Compléter les données de génotypage par des imputations génétiques
    • Contribuer aux analyses de données
    • Assurer une veille des nouveaux outils afin de pouvoir former et conseiller en interne à leur utilisation
    • Rédaction de notes de synthèse

    Il travaillera sous la responsabilité de l’investigateur en charge de ces projets et en étroite relation avec les chercheurs et ingénieurs impliqués dans ces projets.

    Profil recherché : débutants acceptés

    Formation :

    • Au minimum diplôme Master 2 ou ingénieur dans le domaine de l’épidémiologie génétique, de la génomique, de la bioinformatique ou de la biostatistique

    Compétences requises :

    • Compréhension des données
    • Connaissance des bases et outils d’annotation fonctionnelle
    • Maîtrise des outils de gestion et d’analyses statistiques de données volumineuses
    • Maîtrise du langage R, Bash ou Python
    • Travail sous environnement Unix
    • Bonne maîtrise de l’anglais scientifique

    Aptitudes :

    • Qualité relationnelle et goût pour le travail en équipe
    • Sens de l’organisation et rigueur
    • Esprit d’initiative
    • Capacité à travailler en autonomie

    Contrat à durée déterminée (CDD)

    Temps plein de 12 mois, renouvelable, avec perspectives d’évolution

    Date de prise de fonction : à partir d’octobre 2018

    Rémunération selon l’expérience par référence aux grilles de l’Inserm

    Contact(s)

    Thérèse Truong : therese.truong@inserm.fr

    Fichiers joints

    Modalités de candidature

    Envoyer CV et lettre de motivation par mail à Thérèse Truong : therese.truong@inserm.fr