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Offres d'emploi


  1. Chef de Projet en informatique dans le cadre de bases de données clinico-biologiques

    Offre d'emploi. CDD. Paris. Publiée le 03/04/2017.

    Employeur

    A la suite de l’appel à projet en mai 2013 Bases Clinico-biologiques de l’Institut National du Cancer (INCa), le projet CANSOP: Prédispositions aux cancers du sein et de l’ovaire : intégration de caractéristiques génétiques constitutionnelles et tumorales, de facteurs de risque, de données de suivi et des nouveaux gènes de prédisposition a été retenu. Nous recrutons un chef de projet dont la mission sera de poursuivre le projet mise en place en 2014. Il s’agit de rendre inter-opérationnelles les trois bases nationales, GENEPSO, GEMO et UMD-BRCA1/2, indépendantes les unes des autres mais dans lesquelles sont incluses des personnes porteuses d’un variant pathogène des gènes BRCA1 ou BRCA2 et auxquelles sont associées différentes informations. Une part seulement des porteurs est commune aux trois bases. Chacune des bases est régulièrement enrichie par l’ensemble des consultations d’oncogénétique et des laboratoires français. La sélection de patients appartenant à deux, voire les trois bases, a pour objectif la participation à différentes études épidémiologiques reposant sur la réunion d’informations contenues dans les différentes bases.

    • GENEPSO : Cohorte nationale de porteurs (femmes et hommes, atteints ou non) de mutations BRCA1/2,
    • GEMO : Collection nationale de porteurs de mutations BRCA1/2 ayant pour objectif l’identification de facteurs génétiques modificateurs des risques de cancer du sein ou de l’ovaire,
    • UMD-BRCA1/2 : Base de données nationale qui recense tous les variants BRCA1/2 qu’ils soient pathogènes ou non.

    Coordonnées

    Institut Curie, rue d’Ulm, Paris 5.

    Description du poste

    Missions principales

    Ce poste est rattaché au Service de Génétique de l’Institut Curie, et est en lien avec les équipes participant au projet et gérant aujourd’hui les différentes bases. Une interface a été développée sur FileMakerPRo (FMP). Cette interface permet d’établir par l’intermédiaire de scripts SAS la liste des patients inclus dans au moins 2 des 3 bases et de réunir les données les concernant.

    Les missions principales de ce poste sont les suivantes :

    • Lancer les recherches de « communs » suite à de nouvelles inclusions
    • Faire les mises à jour des données des différentes études dans CANSOP
    • Réaliser des requêtes spécifiques et des exports pour répondre à des appels à projet
    • Assurer la maintenance de l’interface CANSOP

    Profil recherché : débutants acceptés

    Compétences et diplôme requis

    Diplôme d’ingénieur informaticien/data manager/ avec expérience préalable en projets de développement en sciences de la vie (plus particulièrement en génétique et biologie).

    Une expérience sur la conception et la modélisation des bases de données, la connaissance des standards inter-opérables et des ontologies dans le domaine de la santé, ainsi que la mise en œuvre d’application web, sont des prérequis. Une bonne connaissance du logiciel Access est demandée ainsi qu’une expérience en manipulation de données (sous un logiciel tel que SAS, Stata, R…). La connaissance de FileMakerPRo et de SAS sont un plus.

    Une capacité de communication et de partage d’information est attendue.

    Contrat à durée déterminée (CDD)

    Date de début et durée du contrat : Le plus tôt possible. Contrat à durée déterminée de 14 mois.

    Niveau de poste : Cadre 1 (env. 2 838€ brut/mois)

    Fichiers joints

    Modalités de candidature

    Adresser lettre de motivation et CV au Pr Dominique Stoppa-Lyonnet, Dominique.stoppa-lyonnet@curie.fr et à Sandrine Caputo, sandrine.caputo@curie.fr.